House è molto depresso a causa dello sbaglio riguardo la sua ultima diagnosi e ciò lo sta distruggendo anche dal punto fisico oltre che mentale. Il dottore continua a provare forti dolori anche se continua a negare il fatto.
Il prossimo caso di House riguarda un bambino di appena 7 anni di nome clancy, frutto di una fertilizzazione in vitro. I suoi sintomi sono i seguenti: un gran sanguinamento rettale ed inoltre disturbi mentali che gli fanno credere di essere sotto tortura aliena.
Nel corso degli accertamenti il team di House rileva risultati contrastanti e quando Clancy dice di avere nel collo un dispositivo inserito dagli alieni, con successivo accertamento positivo da parte dei medici, tutti non sanno più cosa pensare.
Cuddy e Wilson, nel frattempo, decidono di continuare a tenere il silenzio sulla diagnosi di House che non era negativa così che House non si credi sempre infallibile.
Anche Cameron è all'ascolto indignata ma Wilson e Cuddy la convincono a tenere il silenzio.
L'equipe nel frattempo è sempre più convinta della tortura aliena che Clancy continua ad affermare poichè troverà delle cellule con DNA differente nel suo corpo.
House intanto è sempre più frustato e ciò lo porta a non essere di aiuto alla cura della malattia, portando Cuddy ad avere ripensamenti sul fatto di rivelare la situazione ad House.
Clancy verrà diagnosticato come un embrione dato dalla fusione di due gemelli e perciò avente due tipi di DNA differenti.